單細胞抗體測序分析服務

單細胞抗體技術(single B cell antibody technology)是抗體發現的全新技術手段,通量高、漏篩率低,且沒有體外篩選抗體不是天然配對的弊端,有著廣闊的前景。泓迅科技的單細胞抗體服務,包括B細胞抗體的研發與制備,及B細胞抗體測序和深度分析等。

B細胞,即B淋巴細胞,主要執行機體的體液免疫,在抗原刺激下分泌產生抗體并發揮作用。在適應性免疫應答期間,活化的B細胞擴增并經歷其B細胞受體(BCR)的體細胞超突變,形成多樣化的細胞克隆。此外,抗體作為復合物分子,其每個重鏈(VH)和輕鏈(VL)中存在三個互補決定區(CDR),并且重鏈的CDR3變化最為豐富,可在V,D和J基因區段之間的連接處形成并且傾向于高水平的超突變。因此,B細胞產生的天然VH / VL抗體對理解抗體生物學和設計至關重要。

泓迅科技基于先進的GenoTM Ab平臺,提供專業的單細胞抗體測序分析服務,可幫助研究人員全面評估免疫系統的多樣性,深入挖掘免疫組庫與疾病的關系。

服務優勢

  • 專有的抗體大數據平臺,可對抗體的重鏈和輕鏈配對進行打分,篩選最可能的完整抗體序列
  • 獨特的內部數據挖掘工具,對抗體測序結果進行預處理,最大程度避免假陽性等測序誤差
  • 完備的生物信息學分析,經驗豐富的抗體研究團隊,深度挖掘高價值信息
  • 女皇之心客服

    服務流程

    單細胞抗體測序分析服務1

    泓迅經典案例

    泓迅科技根據客戶所提供的抗體測序原始數據,通過生物信息學分析,對細胞VDJ重構、V/J基因頻率、V-J成對使用頻率、CDR3長度分析、B細胞克隆計數、受體多樣性分析、組間多樣性差異分析、組間V、J基因差異分析、組間克隆表達CDR3長度分布差異等詳細分析,并提供了專業的研究報告。

    結果展示:
    1) VDJ 基因使用頻率分析

    Table BCR樣本中 V 基因使用頻率統計

    Gene_name Reads Frequency
    4-39*01 27980 4.97
    4-34*01 12488 2.22
    1-2*02 5007 0.889
    3-74*01 4798 0.852
    1-18*01 3011 0.535
    3-7*01 2862 0.508
    2-70*13 2313 0.411
    3-74*03 2240 0.398
    1-69*01 1943 0.345
    4-31*03 1583 0.281

    單細胞抗體測序分析服務2

    2) CDR3 區域長度分析

    單細胞抗體測序分析服務3

    3) CDR3種類分析

    BCR測序統計CDR3氨基酸序列長度

    CDR3 Reads Frequency len
    DNNNDMR 3560 0.004869 7
    VISRTL 1688 0.002308 6
    AVDSNYQLI 899 0.001229 9
    AVNRDDKII 718 0.000982 9
    AATDSWGKLQ 696 0.000952 10
    AVTDSWGKLQ 627 0.000857 10
    AVNTGNQFY 595 0.000814 9
    AVTGGGNKLT 573 0.000784 10
    AVPTGTASKLT 562 0.000769 11
    LVGDTGRRALT 540 0.000738 11
    AEITLT 517 0.000707 6

    4) 序列總長排序

    BCR氨基酸序列總長reads數

    氨基酸基因序列長度 氨基酸數目 豐度
    1491 147 0.096324
    20 139 0.044324
    540 143 0.040395
    529 145 0.041238
    516 147 0.041955
    504 143 0.042773
    496 141 0.043976
    441 145 0.040898
    433 145 0.041868
    387 148 0.039055

    5) 不同樣本之間的VH基因的頻率差異分析

    單細胞抗體測序分析服務4

    6) 樣本測序飽和度分析

    單細胞抗體測序分析 單細胞抗體測序分析1

    7) 克隆多樣性分析

    克隆多樣性分析

    上機類型 Shannon Entropy Inverse Simpson
    BCR 19.7458 340.758

    服務詳情

    服務名稱 主要內容 分析軟件 交付周期 交付項目
    單細胞抗體測序分析服務 測序數據挖掘;
    抗體信息分析等
    R, Python
    Software等
    7~10天 分析報告

    * 如需訂購抗體測序服務,請了解相關服務:雜交瘤細胞抗體基因測序抗體組庫/免疫組庫測序,或詳詢[email protected]

    抗體測序生信分析服務訂購

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